Defesa de Dissertação – AUGUSTO GARCIA SCHMIDT
Título: AAE-DeMo: Uma Proposta de Arquitetura Baseada em Algoritmos Evolutivos para Descoberta de Motifs em Expressões Genéticas
Autor: AUGUSTO GARCIA SCHMIDT
Orientação:
- Marilton Sanchotene de Aguiar, Orientador (PPGC-UFPel)
Banca Examinadora:
- Paulo R. Ferreira Jr. (PPGC-UFPel)
- Ricardo Matsumura Araujo (PPGC-UFPel)
- Luciano da Silva Pinto (Universidade Federal de Pelotas)
Data: 18 de Agosto de 2017
Hora: 08:00
Local: Sala 308
Resumo:
Motifs não são entidades aleatórias encontradas nas cadeias de DNA. O Motif também pode ser definido como um fenômeno não único. Já os Motifs, além de ter padrões recorrentes na sequência analisada, também possuem uma função biológica. Os algoritmos evolutivos são amplamente utilizados para encontrar soluções para otimização e padrões de pesquisa na área de ciência da computação. Encontrar motivos em sequências de genes é um dos problemas mais importantes na bioinformática e pertence à classe NP-Completo. Portanto, é plausível investigar a hibridação de ferramentas consolidadas, mas limitado em seu desempenho, em combinação com técnicas de algoritmos evolutivos. Este trabalho tem a premissa de mostrar uma pesquisa das principais técnicas e conceitos de algoritmos evolutivos utilizados na descoberta de padrões (motifs) na expressão gênica e também um estudo aprofundado dos principais algoritmos de bioinformática que são usados para esta função em recentes anos por pesquisadores. Entende-se que tais técnicas em combinação, podem obter resultados interessantes para pesquisa em bioinformática. Assim, propondo uma arquitetura otimizada para motivos em expressões genéticas de regiões promotoras da bactéria. Usando tantos algoritmos evolutivos, como algoritmos de bioinformática e técnicas de refinação de seus principais dados fornecidos pelos algoritmos utilizados. Assim, formando uma arquitetura com melhor desempenho devido à hibridização de ferramentas consolidadas para buscar padrões em expressões genéticas.